Ignacio Alonso wurde im Februar 2019 Präsident des Uruguayischen Fussballverbandes (AUF), nachdem er zuvor Mitglied des AUF-Exekutivkomitees war. Vor seiner Tätigkeit bei AUF arbeitete er für den in Montevideo ansässigen Club Rampla Juniors.

Seit November 2019 ist er CONMEBOL-Vertreter im FIFA-Rat.