Das höchste Gremium und Entscheidungsorgan der FIFA ist der Kongress, dem sämtliche Mitgliedsverbände angehören. Jeder Nationalverband hat im FIFA-Kongress eine Stimme. Das nicht-geschäftsführende Organ ist der FIFA-Rat, der durch den FIFA-Präsidenten geleitet wird. Die ständigen und operativen Ausschüsse beraten und unterstützen den FIFA-Rat in seiner Arbeit. Das Generalsekretariat schließlich ist für die Verwaltung der FIFA zuständig (Art. 21 der Statuten).