Joseph S. Blatter wurde im Laufe seiner vielseitigen Tätigkeit mit verschiedenen Preisen und Ehrungen ausgezeichnet. Er ist unter anderem:

• Träger des Olympischen Ordens
• Ehrenmitglied des Schweizerischen Fussballverbandes SFV
• Empfänger zahlreicher Auszeichnungen von Vereinen, Verbänden und Konföderationen
• Träger des "Order of Good Hope" der Republik Südafrika
• Vom Sultanat von Pahang (Malaysia) zum Ritter (Dato') geschlagen
• "Order of Independence (1st class)" von Jordanien
• "Grand Cordon du Wissam Alaouite" von Marokko
• "Medalla al Mérito Deportivo " von Bolivien
• "Grand Cordon de l'Ordre de la République Tunisienne" von Tunesien
• "International Humanitarian of the Year" und "Golden Charter of Peace and Humanitarianism" von der Internationalen Humanitären Liga für Frieden und Toleranz
• Empfänger des "American Global Awards for Peace"
• Empfänger des Ranges des Großoffiziers von Wissam Al Arch (Marokko)
• Empfänger der UEFA-Verdienstorden in Diamant
• Empfänger der Verdienstorden von Jemen
• Empfänger des Verdienstordens für Sport der Republik Korea
• Empfänger des Großen Verdienstkreuzes der Bundesrepublik Deutschland
• Ritter der französischen Ehrenlegion
• Empfänger des "Ordens der zwei Nile" des Sudans
• Ausgezeichnet in Djibouti zum "Commandeur de L'Ordre National du 27 Juin 1977"
• Honorary Doctor of Arts, De Montfort University (Leicester)
• Ausgezeichnet im südafrikanischen Port Elizabeth mit der Ehrendoktorwürde in Philosophie von der Nelson Mandela Metropolitan University
• Ehrenbürger seines Heimatortes Visp
• Ehrenmitglied von Real Madrid
• Träger des Ordens des Nationalen Olympischen Komitees von Belarus
• Träger des Ordens Jarowslas des Weisen (Ukraine)
• Träger des "Dustlik"-Ordens (Usbekistan)
• Träger des Danaker-Ordens (Kirgisistan)
• Träger der "Crown of Peace" (Indien)
• Träger des Großen Silbernen Ehrenzeichens für Verdienste um die Republik Österreich
• Dr. h.c. Internationale Universität Genf
• Träger des Ordens Francisco de Miranda - Primera Clase, Palace Miraflores, Venezuela 2007
• Ehrendoktor der aserbaidschanischen Staatsakademie für Körperkultur und Sport
• Träger des Ehrendiploms von Ilham Aliyev, Staatspräsident Aserbaidschan
• Ehrenbürger von Bangkok
• Ehrendoktor im Bereich Sportmanagement an der Chandrakasem Rajabhat Universität in Bangkok
• Träger des Ehrenordens des Königreichs Bahrain
• Ehrenmitglied der Swiss Olympic Association
• "Best World Sports Award" von der Graduate School of Business Administration in Zürich
• Träger des Ordens von Jerusalem ("Wissam Al-Qods")
• Empfänger des "Kristall von Davos"
• Träger des Großen Silbernen Ehrenzeichens für Verdienste um die Republik Österreich
• Träger des japanischen Ordens der aufgehenden Sonne
• Träger des kasachischen "Dostik"-Ordens
• Träger der Colombe de la Paix de Genève
• "Golden Key recognition", Johannesburg, 5. Juli 2010
• Ehrenmitglied des Deutschen Fussball-Bundes (DFB)
• Verdienstorden für Sport der Republik Korea
• Ehrenkollier des Ecuadorianischen Fussball-Verbandes
• Ehrendoktortitel für Wissenschaften der Université du Bénin (Nigeria)
• Dato' Sri – Erste Klasse Groß-Kommandeur des am Höchsten Ausgezeichneten Kommandos des Sri Sultan Ahmad Shah Pahang
• Ehrenbürger der Demokratischen Republik Timor-Leste
• "Ehrengast der Stadt" (Guatemala-Stadt, Guatemala)
• "Orden als Ehrengast der Stadt" (Managua, Nicaragua)
• Empfänger des "Orden Nacional al Mérito Deportivo" des kolumbianischen Fussballverbandes
• Empfänger des "Orden al Mérito de Bogotá" von Alcaldesa Mayor - Sra. Clara López Obregón (Bürgermeister von Bogotá, Miss Clara López Obregón)
• Freundschaftsmedaille der Regierung von Laos in Anerkennung der Unterstützung der Fussball-Entwicklung im Land
• Preis für die Menschlichkeit im Fussball in Russland, 19. Januar 2012
• Ali della Vittoria-Preis, Rom, April 2012
• Träger des nationalen Verdienstordens von Algerien, 30. April 2012
• Verdienstorden des algerischen Fussballverbandes FAF, 01. Mai 2012
• Empfänger des Diamant-Ordens des usbekischen Fussballverbandes, 16. Mai 2012
• Empfänger des großen goldenen Sterns des chilenischen Fussballs, 16. Juni 2012
• Träger des Verdienstordens Bernardo O'Higgins (Commander), 16. Juni 2012
• Träger des Ehrenordens von Moldawien, 20. September 2012
• Auszeichnung als "Botschafter der Palästinenser", 13. November 2012
• Auszeichnung mit dem "Etoile du Valais d'Honneur 2012", 6. Dezember 2012
• Auszeichnung mit dem "Mohammed Bin Rashid Al Maktoum Creative Sports Award", 6. Januar 2013
• Nationaler Verdienstorden 2. Klasse (Großoffizier) Guineas, 7. Februar 2013
• Aufnahme in die CAF Hall of Fame, 10. März 2013